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ヒトゲノムの全エクソン領域をキャプチャするSureSelectターゲットDNA濃縮キットがSOLiD(TM)に対応

 

 

 

2009年11月10日

 アジレント・テクノロジー株式会社(社長:海老原 稔、本社:東京都八王子市高倉町9番1号)は、ヒトゲノムのエクソン部分の全領域を、次世代シーケンシング装置を用いて容易に解析できるターゲットDNA濃縮キット「Agilent SureSelect Human All Exon Kit(シュアセレクト・ヒューマン・オール・エクソン・キット)」がApplied BiosystemsのSOLiDシステムに対応したことをお知らせします。Applied BiosystemsはLife Technologies社の一部となっています。このキットにより、次世代DNAシーケンシングの前にターゲットDNAの濃縮を行うことができます。

 「Agilent SureSelect Human All Exon Kit」は、当社の「SureSelect Target Enrichment System」の効率性とコストパフォーマンスを改善したもので、ヒトゲノムから約38 Mb(メガベース)のエクソン領域すべてを取り出して解析を行うことができるターゲットDNA濃縮キットです。カタログキットのため、手間のかかる設計作業を行うことなくすぐに使用することができます。数サンプルから数千サンプルまでの研究に最適なキットサイズを提供しており、研究のスケールアップも容易なほか、自動化にも適しています。

 当社の先端ゲノミクスアプリケーション担当プロダクトマネージャで博士でもあるフレッド・エルナニ(Fred Ernani)は次のように語っています。
「当社は次世代シーケンシング・ターゲットDNA濃縮キットを、先月発表したイルミナ(Illumina)社のGA IIに引き続き、Applied Biosysytems SOLiDシステムにも対応させることができたことをうれしく思っています。『Agilent SureSelect Human All Exon Kit』のパフォーマンス、使いやすさ、拡張性は、これらの次世代シーケンサの能力と効率の増大という流れに合致したものです。」

 「SureSelect Human All Exon Kit」は、NCBI Consensus CDS Database (CCDS)に登録されている、ヒトゲノム領域の1.22 %に相当する18万以上のエクソン領域をカバーするだけでなく、Sanger v13データベースに登録されている700以上のヒトmiRNAや300以上のノンコーディングRNAも含みます。

 マックス・プランク研究所 分子遺伝学部門 癌ゲノミクス・グループ(Cancer Genomics Group of the Max Planck Institute for Molecular Genetics)のミハル・シュバイガー(Michal Schweiger)博士は次のように語っています。
「Applied Biosystems SOLiDシステム対応の『Agilent SureSelect Human All Exon Kit』は、きわめて有効に機能しています。サンプルとなるDNAの量が非常に少なくすみ、プロトコルも容易でわかりやすいものです。我々はこの技術に非常に満足しています。特に、得られるDNAの量に制限のある癌研究分野において有用です。」

 当社の「SureSelect Target Enrichment System」は、さまざまなシーケンス・プロトコルやプラットフォーム向けに最適化されたプロトコルを提供するプラットフォームとなっています。SOLiDシステムのフラグメント・ライブラリ・フォーマット・シーケンシングのほか、イルミナ社のシングルエンド・シーケンシングやペアエンド・シーケンシング・プロトコルにも対応しています。当社のオンライン設計ツール「eArray」のユーザは、興味のある任意の領域を1本のチューブに入れたカスタム製品を簡単に設計することで、研究の効率を高めることができます。

主な特長
*ヒトゲノムの全エクソン領域を分析可能:
ヒトゲノムから約38Mbのエクソン領域すべてを1度のキャプチャ操作で取り出し、そのまま次世代シーケンサによる分析を行うことができます。また、カタログキットのため、手間のかかる設計作業を行うことなく直ちに使用することができます。

*多検体処理が容易:
マグネティックビーズを用いた、液相法による分離洗浄なので多検体への対応が容易で96穴プレートを用いた自動化も可能です。

*点突然変異やin/delがあっても効率よくターゲット領域を回収可能:
120-merの超長鎖オリゴを使用しているので、ターゲット領域に点突然変異や5bp程度の欠失があってもターゲット領域を回収できます。

 「Agilent SureSelect Target Enrichment System」についての詳細は、以下のウェブサイトでご覧いただけます。
 http://www.opengenomics.com/SureSelect

 eArrayには、こちらからアクセスいただけます。
  https://earray.chem.agilent.com

販売方針
*目標市場:次世代シーケンサにより、エクソン領域の変異を対象とした疾患の病因解析を行う研究者向け
*販売価格(発表日時点での税込参考価格です):901,950円 (5反応分)
*出荷開始日: 2009年11月


アジレント・テクノロジーについて

アジレント・テクノロジー(NYSE:A)は、コミュニケーション、エレクトロニクス、ライフサイエンス、化学分析市場における世界のプレミア・メジャメント・カンパニーであり、またテクノロジー・リーダーでもあります。18,000名の従業員を擁し、110カ国以上でビジネスを展開しています。アジレントは、2008年度、58億ドルの売上高を達成しました。アジレント・テクノロジーの情報は、以下のウェブサイトでご覧ください。
http://www.agilent.co.jp

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